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布鲁斯·克努森博士
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研究项目和附属机构
研究兴趣
RNA聚合酶I转录(结构, 组装, 监管), 核仁的生物学, 大分子结构, 交联, 蛋白质组学, 生物信息学, 建模, 分子遗传学, 生物化学, 模型系统
研究抽象
![无花果.1. 核仁的](http://8ezw.e-keicho.com/scripts/faculty/abstract/images/knutsonb-1.jpg)
一个世纪以来癌症的标志是核仁增大 (图.1), 一个独特的核亚室,RNA聚合酶I (Pol I)转录和核糖体生物发生在这里. Pol I转录在癌细胞中不受调节,并驱动细胞增殖, 使其成为一个有吸引力的抗癌治疗靶点. 我们的主要研究重点是阐明Pol I转录的分子机制及其失调如何导致癌症和疾病. 我们的研究采用了一种创新的跨有机体和跨学科的方法,整合了生物信息学, 生物化学, 计算生物学, 遗传学, 酵母和人体模型系统的蛋白质组学和结构生物学.
Pol I预起始复合物(PIC)的分子结构
![无花果. 2. Pol I PIC模型](http://8ezw.e-keicho.com/scripts/faculty/abstract/images/knutsonb-2.jpg)
Pol I转录始于PIC的形成 (图.2), 这是一种由20多种不同蛋白质组成的大分子组合,这些蛋白质协同作用,准确定位启动子上的Pol I,并帮助启动转录. 我们对Pol I PIC形成的关键结构方面以及它如何在癌症和病变细胞中改变感兴趣. 我们的实验室使用复杂的蛋白质-蛋白质相互作用制图技术的综合组合,如化学交联/质谱联用,以确定Pol I PIC组分的空间方向,以及它们在转录周期和患病状态下如何变化.
Pol I与颅面畸形. Pol I突变导致常染色体显性颅面异常,称为Treacher Collins综合征(TCS)。. TCS的特点是下颌和颧骨发育不全,从童年到成年早期需要进行广泛的多阶段手术重建. 我们对这些Pol I突变如何引起TCS很感兴趣, 它们如何影响Pol I活性, 以及如何抑制它们来预防疾病. 目前,还没有已知的治疗TCS和其他相关颅面畸形的方法.
![无花果.3. Pol规例](http://8ezw.e-keicho.com/scripts/faculty/abstract/images/knutsonb-3.jpg)
Pol I在癌症中的失调. 癌细胞中Pol I转录的上调与许多癌基因的激活突变和被认为直接调节Pol I活性的肿瘤抑制基因的功能突变缺失相吻合 (图.3). 然而,它们真正的Pol I靶点和相互作用的位点仍不清楚. 了解这些癌症蛋白是如何靶向Pol I复合物的, 我们使用蛋白质交联技术结合分子遗传学和生物化学来鉴定和表征体内直接和功能相关的Pol I靶点. 这些研究将阐明控制异常Pol I活性的新策略.
克努森实验室的研究生研究. 感兴趣的学生应直接联系布鲁斯·克努森讨论可用的研究机会.
克努森巴, McNamar R, Rothblum LI. RNA聚合酶I TFIIF/ tfiie样亚复合物的动力学:一个小型综述. 生物化学Soc. 2020年10月30日;48(5):1917-1927. doi: 10.1042 / BST20190848.
克努森巴, Smith ML, Belkevich AE, Fakhouri AM. RNA聚合酶I上游激活因子的分子拓扑结构. Mol细胞生物学. 2020年6月15日;40(13):e00056-20. doi: 10.1128 / MCB.00056-20. 2020年6月15日.
刘建军,李建军,李建军,李建军. RNA聚合酶I亚基paaf53的条件耗尽表明它对有丝分裂至关重要,并且能够识别功能域. 生物化学. 2019年12月27日;294(52):19907-19922. doi: 10.1074 / jbc.RA119.009902. Epub 2019 11月
Jackobel AJ, Zeberl BJ, Glover DM, Fakhouri AM, 克努森巴. S. cerevisiae RNA聚合酶I核心因子揭示了GC-minor凹槽的偏好和保守的结合机制. 生物化学,生物物理,基因调控机制. 2019年9月,1862 (9):194408. doi: 10.1016/j.bbagrm.2019.194408. Epub 2019 8月2日.
李建军,崔伟,李建军,李建军. RNA聚合酶I上游激活因子的重构及组蛋白H3和H4在复合体组装中的作用. J摩尔生物学. 2018年Epub
韩勇,何勇,刘建军,刘建军. 打破模式:RNA聚合酶I转录复合物的结构揭示了起始的新途径. 转录. 2018年1月15:1-7
Walker-Kopp N, Jackobel AJ, Pannafino GN, Morocho PA, Xu X, 克努森巴. 酿酒酵母的Treacher Collins综合征突变破坏RNA聚合酶I和III复合体的完整性. Hum Mol 基因t. 2017年11月1日;26(21):4290-4300.
韩勇,闫超,阮泰东,Jackobel AJ, Ivanov I, 克努森巴,何勇. RNA聚合酶启动atp非依赖性转录的结构机制ⅰ. Elife. 5 . 2017年6月17日.
克努森巴, Smith ML, Walker-Kopp N, Xu X. 超延伸络合物含有tfif相关的亚络合物. 转录. 2016. 7(4):133-40
克努森巴, Lui J, Ranish J. 哈恩年代. S的体系结构.核糖核酸聚合酶I核心因子复合体. 自然、结构与分子生物学. 2014. 21(9): 810-816
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克努森巴. tfiib样因子在植物界的出现和扩展. 基因. 2013. 526(1): 30-38
克努森巴, 哈恩年代. 酵母rn7和人TAF1B是tfiib相关RNA聚合酶I的通用转录因子. 科学. 2011. 33(6049): 1637-40
克努森巴, 哈恩年代. Tra1结构域对SAGA和NuA4复合体的激活子募集和转录辅激活子功能很重要. Mol细胞生物学. 2011. 31(4): 818-831
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